Protein–RNA interactions for Protein: P70324

Tbx3, T-box transcription factor TBX3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx3P70324 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx3P70324 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx3P70324 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx3P70324 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx3P70324 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbx3P70324 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbx3P70324 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms