Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cux2P70298 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Cux2P70298 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux2P70298 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux2P70298 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms