Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms