Protein–RNA interactions for Protein: P70269

Ctse, Cathepsin E, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtseP70269 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtseP70269 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtseP70269 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtseP70269 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtseP70269 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtseP70269 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtseP70269 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms