Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn1P70268 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms