Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms