Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc9P70170 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms