Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cntn5P68500 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn5P68500 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms