Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4bP68372 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms