Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms