Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms