Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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