Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnnP61807 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnnP61807 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnnP61807 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnnP61807 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnnP61807 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnnP61807 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms