Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms