Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Depdc5P61460 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Depdc5P61460 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms