Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abce1P61222 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abce1P61222 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms