Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr2fP61219 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms