Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms