Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap25P60879 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap25P60879 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap25P60879 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap25P60879 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms