Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif4a1P60843 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif4a1P60843 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif4a1P60843 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms