Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rin3P59729 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rin3P59729 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rin3P59729 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rin3P59729 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms