Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b6P59708 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b6P59708 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms