Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ythdf1P59326 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms