Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Strn4P58404 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Strn4P58404 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Strn4P58404 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Strn4P58404 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms