Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpa1P57784 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpa1P57784 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms