Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms