Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Bace1P56818 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bace1P56818 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bace1P56818 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms