Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms