Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lim2P56563 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms