Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms