Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrlP54846 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrlP54846 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrlP54846 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrlP54846 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrlP54846 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrlP54846 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NrlP54846 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NrlP54846 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NrlP54846 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NrlP54846 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrlP54846 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrlP54846 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms