Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CnbpP53996 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CnbpP53996 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms