Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PctpP53808 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PctpP53808 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PctpP53808 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms