Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fdft1P53798 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms