Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux1P53564 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms