Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms