Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2e3P52483 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms