Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp10P52479 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms