Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pold1P52431 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms