Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfP51642 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CntfP51642 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CntfP51642 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms