Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs12P50716 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs12P50716 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs12P50716 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs12P50716 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs12P50716 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs12P50716 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs12P50716 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms