Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms