Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmod1P49813 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms