Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb42P49222 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms