Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ercc3P49135 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms