Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CitP49025 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CitP49025 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CitP49025 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CitP49025 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CitP49025 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms