Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms