Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms