Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf1P46099 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf1P46099 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms