Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-6P43688 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms